【摘 要】
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目的:通过生物信息学方法预测hsa-miR-130家族靶基因及其功能机制.方法:检索PubMed有关hsa-miR-130家族的研究报道并进行相关分析;检索miRbase获取hsa-miR-130家族序列;通过miRanda、TargetScan、PicTar数据库交叉预测靶基因,对其进行功能富集分析和信号转导通路富集分析.RT-qPCR验证hsa-miR-130a-3p在系统性红斑狼疮(SLE)患者PBMC中的表达情况.结果:hsa-miR-130家族成熟序列在各物种间高度保守;多数据库联合预测获得的2
【机 构】
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宁夏医科大学基础医学院医学遗传学系与细胞生物学系,宁夏医科大学生育力保持教育部重点实验室,银川750004
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目的:通过生物信息学方法预测hsa-miR-130家族靶基因及其功能机制.方法:检索PubMed有关hsa-miR-130家族的研究报道并进行相关分析;检索miRbase获取hsa-miR-130家族序列;通过miRanda、TargetScan、PicTar数据库交叉预测靶基因,对其进行功能富集分析和信号转导通路富集分析.RT-qPCR验证hsa-miR-130a-3p在系统性红斑狼疮(SLE)患者PBMC中的表达情况.结果:hsa-miR-130家族成熟序列在各物种间高度保守;多数据库联合预测获得的285个靶基因存在于细胞的多个组分,主要包括调控细胞周期、信号转导、DNA合成调控等分子功能;并富集于雌激素膜受体信号转导等其他信号通路;hsa-miR-130a-3p在SLE患者中表达下调.结论:hsa-miR-130家族靶基因功能富集于多个生物学过程,并通过调控免疫相关靶基因参与SLE疾病过程,可作为潜在疾病研究标志物.
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