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阐述了3种不同基质（乙酸盐、丙酸盐和葡萄糖）在强化生物除磷系统中的生化模型反应机理。重点介绍了聚磷菌（PAOs）、聚糖菌（GAOs）和产乳酸菌在厌氧／好氧条件下对能量及还原力（NADH2）的利用方式；聚-β-羟基链烷酸盐（PHA）的合成方式及存在形式，糖原、乳酸（L型）的代谢途径等。虽然控制基质条件可以实现稳定的强化生物除磷效果，但目前的生化模型并不能完全解释所有的代谢过程，今后要在分离纯种的PAOs及相关生化代谢过程中酶的活动等方面进行深入研究。