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从东乡野生稻（Oryza rufipogon Griff）中克隆到7个重复序列，序列分析表明：这些序列是与转座因子有关的序列。以序列H2为探针，对不同基因组水稻进行Southern杂交，表明该序列为稻属内AA基因组特异的重复序列。其分布在水稻的多条染色体上，荧光原位杂交（FISH）结果显示该重复序列主要位于染色体的着丝粒以及端粒附近，重复单位序列长度为615bp左右。并就特异重复序列在水稻研究中的应用进行了讨论。