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马尔堡病毒与埃博拉病毒同属于“丝状病毒科”家族，它的发现早于埃博拉病毒。在1967年秋，西德马尔堡、法兰克福和南斯拉夫贝尔格莱德的几所医学实验室的工作人员中同时暴发了一种严重出血热，有31人发病，其中7人死亡，这些患者大都接触过一批从乌干达运来的非洲绿猴。科学家们对患者的血液和组织细胞进行了培养，分离出一种以前没有见到过的病毒。根据发病地点，将这种病毒命名为马尔堡病毒。以后，在南非、肯尼亚和津巴布韦也相继出现过马尔堡病毒感染的病例。近年来较大的一次流行发生在1998年至2000年的刚果民主共和国，马尔堡病