目的了解北京市丰台区手足口病的流行现况,为手足口病防治提供依据。方法对2016-2017年北京市丰台区手足口病病例资料进行描述性流行病学分析;对采集的病例标本进行肠道病毒检测并进行病原学特征分析。结果2016-2017年北京市丰台区累计报告病例5 171例,年均发病率为111.21/10万。手足口病高发于6岁以下儿童,占病例总数的86.04%,发病患者男女性别比为1.53∶1。散居儿童和幼托儿童是发病的主要人群,共占病例总数的88.84%。2016年和2017年均有两个发病高峰,2016年为6-7月,10-11月;2017年为7-8月,10-11月。地区间发病水平差异明显,卢沟桥街道病例总数(763例,190.65/10万)和花乡年均发病率(700例,222.14/10万)高于全区其他地区。实验室阳性病例611例,EV71占21.60%,Cox A16占26.84%,Cox A 6占27.17%,其他肠道病毒24.39%。结论北京市丰台区手足口病流行有明显的人群分布和地区分布差异,呈多病原共流行态势,应加强手足口病病原学监测工作。