【摘 要】
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目的了解厦门市结核分枝杆菌基因类型分布及主要流行基因群情况,并建立分型数据库。方法采用实时荧光PCR法对厦门市2013-2015年分离到的466株结核分枝杆菌临床分离株进行菌株
【机 构】
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厦门市疾病预防控制中心,厦门大学生命科学学院,厦门大学附属中山医院,
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目的了解厦门市结核分枝杆菌基因类型分布及主要流行基因群情况,并建立分型数据库。方法采用实时荧光PCR法对厦门市2013-2015年分离到的466株结核分枝杆菌临床分离株进行菌株确认,然后采用间隔区寡核苷酸分型方法(spoligotyping)对其进行基因分型。分型结果与Spol DB4数据库进行比对,并使用Bionumeric6.6.4软件进行基因聚类分析。结果 466株菌均为结核分枝杆菌,基因分型分成96种基因型别,62种数据库中有相应的SIT编号,34种为新的型别。97.64%(455/466)的菌构成了15个基因簇。466株菌属于7个基因家族及未定义家族,排在前三的分别为:Beijing(北京)家族60.09%(280/466)、T家族21.03%(98/466)、H家族5.58%(26/466)。结论厦门市结核分枝杆菌基因型别呈现多样性,北京家族为主要的流行基因群。
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