这种计算机将采用非流行的芯片设计。
　　
　　官方消息：中国下一个超级计算机千万亿次曙光6000，将史无前例地采用国产处理器。龙芯系列处理器(“Godson”)的首席架构师、中科院计算所的胡伟武也证实这款超级计算机将运行Linux系统。这和中国上一台超级计算机曙光5000a相比是巨大的变革，曙光5000a已经跻身于2008年度全球最快计算机第11位，它采用的是AMD芯片，运行Windows HPC Server系统。
　　曙光6000处理器的诞生是龙芯系列处理器的一个重要里程碑，龙芯系列处理器目前只在廉价低端的上网本和上网个人电脑使用。当曙光5000a最初发布时，它本也打算使用龙芯处理器，但制造计算机的曙光信息产业公司鉴于龙芯处理器对Windows操作系统缺乏有力支持，并且，中科院计算所未能及时提供足够强大的处理器芯片，他们最终采用了AMD的芯片。
　　胡表示，曙光6000最晚在2010年年中完成，最早在年底装机运行。这是中科院计算所的代表第二次允诺超级计算机将采用龙芯处理器。
　　龙芯3代的开发始于2001年，属于中国的第十个“五年计划”。所有龙芯系列芯片都是每秒处理百万机器指令的处理器——最初是上世纪80年代开发，目前已经被桌面计算机和服务器淘汰，但仍在许多嵌入式设备中使用。目前，性能前500强的处理器被X86构架的芯片统治，非X86的处理器在该排名中只有不到15％。
　　“当芯片在聚簇配置下运行时，它将是一款非常高性能的、每秒百万指令构架的处理器。”位于加州桑尼维尔的MIPS Technologies公司市场部副总裁阿特·斯威夫特(Art Swift)说。正是该公司开发了每秒百万指令运算的构架技术。
　　2009年发表的一篇论文提出，使用多达16核的聚簇龙芯3芯片可以达到极高的性能。《微处理报告》的分析员汤姆·哈夫希尔(Tom Halthill)计算出在这样的配置下，达到千万亿次运算性能(每秒万亿次操作)将需要782快16核芯片。
　　哈弗希尔认为，龙芯3和目前最新一代的已在商业个人计算机上使用的龙芯2F芯片略有不同。主要不同之处是它含有X86指令的硬件转换器(在大多数英特尔和AMD处理器中已经使用)，并且它也集成了多核——从4核到推荐的16核——每个核都能独立处理指令。龙芯3显然没有采用多线程技术，它允许单核可以同时执行多条指令(英特尔和Sun公司已经将多线程技术集成到他们的部分芯片中)。
　　第2代和第3代龙芯芯片使用同样的通用芯核，但龙芯3将更多的核集成在一起。4核龙芯3芯片已有雏形，最终，64纳米工艺的芯片将在12月底试产，这意味着最终的芯片说明将会很快发放给生产厂商意法半导体公司。
　　虽然四核龙芯3将会在从桌面计算机到机顶盒(芯片将集成附加指令，专门加速多媒体回放)中得到广泛应用，8核芯片最可能在千万亿次超级计算机中使用。该版本处理器集成4个普通处理器和4个“GStera”协处理器，该协处理器专门为大量数学计算设计。这些协处理器意义重大，因为它们在高强度数学计算和LINPACK性能测试中表现更好。LINPACK性能测试使用线性代数来测试世界上最快的超级计算机，并决定他们在全球500强超级计算机中的排名(这也是其拥有者炫耀的权利)。
　　引进LINPACK标准测试的计算机科学家杰克·唐加拉(Jack Dongarra)表示，曙光6000的架构多核集成特定数学计算的协处理器——符合标准超级计算机的设计模式。
　　4核龙芯3芯片每个核已经集成了2个64比特浮点单元。所以，理论上它可以作为超级计算机的商品芯片。然而，唐加拉表示，它需要大量这种核来达到同样的处理能力。
　　英特尔仍然不对这样一个由国家支持的高性能计算领域的竞争者感到恐慌。英特尔的发言人查克·莫洛伊(Chuck Mulloy)说：“为一个尚未存在的产品衡量其竞争影响力是有问题的，我们通常不会这么做。在我们整个历史中，我们一直都面对竞争者。我们不指望去改变它——事实上，我们很欢迎竞争者。”
　　唐加拉提醒到，在标准测试进行之前就推测曙光6000的性能是没有意义的，尤其是百万指令构架并非高性能计算的标准。唐加拉说：“虽然我希望它们很好，但我仍然看到，为使整个系统能够工作所要面临的诸多挑战。”这些挑战包括被迫调整曙光运行的软件。
　　在龙芯3诞生之日访问了北京中科院计算所、并做了报告的哈弗希尔相信，无论系统性能如何，中国制造出能同西方生产的芯片竞争的国产芯片只是时间问题。他说：“技术上已经没有什么能够阻止他们制造世界级的处理器了，他们已经拥有了和我们一样智慧的构架师和计算机科学家。”