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使用影响因子评价科技期刊存在的问题包括：以两年作为统计时限太短，统计源覆盖面有限，期刊及刊载论文的类别差异造成的不可比性，以及统计时易产生漏引、错引、自引等问题，在评价论文时容易将高影响因子期刊与高影响力论文混淆。探讨评价医学科技期刊时应从相关专业、方法学、编辑学、引文统计、独立机构的收录或评审及其他方面综合考虑。