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采用PCR方法成功克隆了3株鸡贫血病病毒（CAr）广州株VP3和VPl的部分基因，并进行了核苷酸序列测定。序列分析表明，3株CAV广州株与国内外其他21株CAV毒株的核苷酸序列相似性在89．5％-100．0％之间；推导氨基酸序列的相似性在84．8％-98．2％之间。系统发育进化树分析显示，3株CAV广州株和中国TJBD40、SD22、SD24株都同处于一个分支上，而与马来西亚的SMSC-1株、日本的G6株以及澳大利亚的CAU269／7株的亲缘关系较远。