【摘 要】
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鸡滑液囊支原体（Mycoplasma synoviae， MS）能引起家禽呼吸道疾病、传染性滑膜炎、蛋壳顶端异常及生长迟缓等，给全球养禽业带来巨大的经济损失。然而不同国家和地区MS的耐药性和致病性存在差异，因此本研究旨在挖掘福建MS菌株的特征。作者采集福建省疑似患MS的病鸡关节腔内容物，对菌株进行分离鉴定，并利用三代联合二代测序技术对其进行全基因组测序。结果显示该分离株病原特性稳定，已保藏至中国典
【机 构】
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福建农林大学动物科学学院（蜂学学院）闽台动物病原生物学福建省高校重点实验室福建省畜禽病原感染与免疫学重点实验室福建省-尼泊尔畜禽重大疫病防控联合实验室
【基金项目】
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福建省自然科学基金（2020J05025）； 福建省中青年教师教育科研项目（JAT200093）； 省级大学生创新创业训练计划项目（S202110389053）；
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鸡滑液囊支原体（Mycoplasma synoviae， MS）能引起家禽呼吸道疾病、传染性滑膜炎、蛋壳顶端异常及生长迟缓等，给全球养禽业带来巨大的经济损失。然而不同国家和地区MS的耐药性和致病性存在差异，因此本研究旨在挖掘福建MS菌株的特征。作者采集福建省疑似患MS的病鸡关节腔内容物，对菌株进行分离鉴定，并利用三代联合二代测序技术对其进行全基因组测序。结果显示该分离株病原特性稳定，已保藏至中国典型培养物保藏中心，保藏编号为CCTCC NO: M 2021210，并将其命名为MS-FJ01。MS-FJ01基因组全长为795 381 bp，GC含量为28.39%；预测编码基因数为704个，占整个基因组的90.48%；并在NR、SwissProt、COG、GO和KEGG数据库分别注释到692、446、476、382、425个基因。通过各数据库的分析，注释了40个耐药相关基因，4个碳水化合物相关酶基因，136个病原与宿主互作相关基因，47个毒力因子相关基因，106个膜转运蛋白相关基因，25个限制修饰相关基因。通过与MS HN01和MS 5-9基因组进一步比较发现，MS-FJ01与这两个中国菌株均存在良好的共线性关系，且与MS 5-9的亲缘关系更近。本研究阐明了福建MS菌株的基因组结构、通过相关数据库的分析，预测和注释了其基因的功能，为深入研究MS提供参考依据。
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