随着国家经济体制改革的深入，目前二类调查的指导思想及技术规程越来越不适应社会的发展要求，在社会中包括林业主管部门越来越把森林资源二类调查工作边缘化，越来越停留在摸清林业资源家底的认识层面，具体表现在以下几个方面：
　　1 调查的目的性缺乏前瞻性，不能引起政府重视
　　开展森林资源二类调查的目的。一是查清现有森林资源状况：二是制定林业长远规划；三是制定森林资源经营方案。但《国家林业局森林资源规划设计调查技术规程》），都只强调如何查清森林资源，对制定林业长期发展规划和制定森林经营方案等工作并没有作明确的规定检查验收也未作为验收要件。数量的考核是计划经济的产物，知道自己有多少就行了，具体价值、怎么开发、利用是别人的事。存量同领导政绩挂钩，势必造成数据同领导挂钩数据对于实际应用，产生了不利的影响。使人们更加有理由认为，森林资源调查就是查清森林资源的数量，没有太多的现实意义林业部门也只是在为调查而调查。
　　2 调查成果利用难，造成调查停留在表面化
　　森林资源二类调查成果应该包括本地区的森林资源数据资料，林业发展规划和森林经营方案。但是林业发展规划和森林经营方案编制上述两项成果在现阶段的条件下其使用的可操作性也存在很大疑问。首先是林业发展规划和森林经营方案并无强制性。无论承包者还是林地所有者.他们有权自己选择经营的品种、经营模式，林业部门编制的经营方案对他们有利时，他们可以执行不利时完全可以自行其是。包括区划为生态公益林的林地虽然可以实行强制性保护，但由于目前实行生态效益补偿的林地范围有限而且补偿标准很低一旦林农认识到界定为生态公益林侵害了他们的经济利用而要求退出“生态效益补偿”范围，将其林地作为商品林经营将很难处理，要么提高生态效益补偿标准，这在现实条件下很难实现，也难以达到生态效益应有补偿的标准；要么准许其自由经营，所以林业部门编制的经营方案或林业规划可能成为空话。
　　鉴于目前现状林业改革势在必行，林业是目前改革进度最慢的一个行业，具体到森林资源二类调查随着我国政府对生态环境建设的日益重视和投资力度的加大林业指导思想也实现了从“传统的木材永续利用”到“三大效益兼顾，生态效益优先”的转变特别是林权改革及碳汇发展，要求林业调查需要新思维结合新技术形成新的调查方法。制定和完善符合实际的森林资源二类调查操作细则摸索新的“技术规定”指导下的森林资源二类调查工作经验，提高调查效率和精度，从数量调查到价值调查的转变，同发展碳汇和林权改革要求相协调.是今后发展的方向，可以从以下几个方面着手加以解决：
　　必须通过立法（修改《森林法》及其实施条例）明确林业长远规划的法律地位生态功能的一个重要载体就是碳汇资产的价值，但没有要将生态环境保护和生态安全作为林业长远规划的重要内容，并按此标准确定国家和各地必须达到的森林覆盖率、林地面积、生态公益林所占比例等指标.一切全是空谈。其是不断变化的，在通过林权制度改革、林地确权发证等工作后林地所有权、林地使用权可以保持相对稳定.即使有变化也能通过办理林权变更登记加以明确。用林地权属界线作为区划小班界线的主要因子能相对稳定小班界线避免因小班界线的不确定性造成资源调查成果的不连续和利用困难。通过按林权区划小班界线也能方便森林经营方案编制以及森林经营方案的施行。中对林地的保护标准应与基本农田的保护标准相一致确定全国及各地必须确保的底线。以法律形式确定森林资源规划设计调查 （即二类调查）作为全国森林资源监测和生态环境监测手段的法定地位，将检验全国及各地生态环境保护规划（碳汇发展）执行情况、效果评定作为森林资源二类调查的重要任务。
　　对《森林资源二类调查技术规程》进行调整，将林权调查作为二类调查的最重要内容在查清林权的基础上掌握森林资源数据。最终目标是建立、健全二类调查长效机构对于森林资源实施动态监测由资源管理向资产管理进行转变，最终提高当地的林业资源投入产出比。目前，3S信息管理系统已经得到普通应用通过影像判读，实地检验结合林权档案（林地地籍资料），以生产统计资料作参考，通过建立、健全二类调查长效机构，引入林业价值评价体系建立科学的动态监测管理体系.是林业资源二类调查发展的方向。在思想观念上从木材生产到生态资源再到社会化资产管理，具体体现为面积、蓄积到碳汇能力、社会价值的转变。把生态价值作为是一个地区软实力来研究、发展，通过完整、科学、实际的档案资料；完善、可行的编制林业规划森林资源管理、经营方案；动态监测整个地区的资源发展方向、价值产出比从而在社会、地区发展中体现出二类调查工作的价值和必要性。