【摘 要】
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鱼类诺卡氏菌病(fish nocardiosis)是一种常见的严重危害全球水产养殖业的鱼类疾病。鰤鱼诺卡氏菌(Nocardia seriolae)是鱼类诺卡氏菌病的主要病原菌之一。本研究对已报道的鰤鱼诺卡氏菌17个不同菌株全基因组数据进行比对分析,筛选获得种内保守、种间变异的特异性基因组片段,并设计特异性引物,建立鰤鱼诺卡氏菌特异性PCR检测方法。设计的特异性引物仅能扩增获得鰤鱼诺卡氏菌的特异性片
【基金项目】
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广东海洋大学“冲一流”学科建设科研项目(231419017); 深圳大鹏新区产业发展专项(KJYF202001-08); 深圳市科技计划项目基础研究(自由探索)项目(JCYJ20180306173022502; JCYJ20180507183240459)共同资助;
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鱼类诺卡氏菌病(fish nocardiosis)是一种常见的严重危害全球水产养殖业的鱼类疾病。鰤鱼诺卡氏菌(Nocardia seriolae)是鱼类诺卡氏菌病的主要病原菌之一。本研究对已报道的鰤鱼诺卡氏菌17个不同菌株全基因组数据进行比对分析,筛选获得种内保守、种间变异的特异性基因组片段,并设计特异性引物,建立鰤鱼诺卡氏菌特异性PCR检测方法。设计的特异性引物仅能扩增获得鰤鱼诺卡氏菌的特异性片段,其他近缘菌和常见菌均无PCR扩增片段,且PCR检测灵敏度核酸浓度达80 pg/μL,菌液浓度达8.6 CFU/μL。用该PCR检测方法检测人工感染鰤鱼诺卡氏菌和阴性对照组杂交鳢各组织,结果显示,只能从感染鰤鱼诺卡氏菌的鱼组织中扩增出阳性片段。本研究基于鰤鱼诺卡氏菌不同菌株全基因组数据比对分析,所建立的PCR检测方法比之前的分子检测方法更具科学性、可靠性。该PCR检测方法可以提供一种快速、准确、灵敏的鰤鱼诺卡氏菌检测方式。
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