RasGAP作用下ras P21水解GTP的计算机模拟分析

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利用PDB(brookhaven protein data bank)文库提供的晶体结构数据,从大分子的计算机三维模拟分析入手,分析了ras P21在RasGAP(GTPase-activating protein of RAS)作用下水解GTP的具体机制.对ras P21核苷酸结合口袋的微环境和ras P21在GTP水解过程中的结构变化进行了讨论.在分析ras P21空间三维结构的基础上,分析了催化水解过程中RasGAP的变化.讨论了对于RasGAP和ras P21的结合定位以及对水解过程中ras P21的Switch1的构象变化起重要作用的Lys949手指结构,并给出了ras P21在RasGAP催化下水解GTP的一个模型,其结果是进一步的变异分析的基础.
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