【摘 要】
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AP2/ERF (APETALA2/Ethylene-responsive factor)是一类主要存在于植物中的转录因子,在植物形态发育、对各种胁迫的响应机制、激素信号转导和代谢物调控等生理过程中起到重要作用。萱草(Hemerocallis fulva)作为重要的园林观赏植物广泛用于园林绿化等方面。本研究在课题组获得的萱草‘金娃娃’全基因组测序数据的基础上,利用生物信息学方法对萱草AP2/ERF
【机 构】
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上海应用技术大学生态技术与工程学院
【基金项目】
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国家自然科学基金(31701963); 上海市农业农村委员会科技兴农项目(2019-02-08-00-08-F0110, 2021-02-08-00-12-F00756); 上海应用技术大学中青年教师科技人才发展基金项目(ZQ2021-21)共同资助;
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AP2/ERF (APETALA2/Ethylene-responsive factor)是一类主要存在于植物中的转录因子,在植物形态发育、对各种胁迫的响应机制、激素信号转导和代谢物调控等生理过程中起到重要作用。萱草(Hemerocallis fulva)作为重要的园林观赏植物广泛用于园林绿化等方面。本研究在课题组获得的萱草‘金娃娃’全基因组测序数据的基础上,利用生物信息学方法对萱草AP2/ERF家族进行筛选鉴定,并分析该家族的蛋白理化性质与结构、系统进化关系、亚细胞定位与跨膜结构关系。结果表明,萱草AP2/ERF家族共有153个成员,含有9个保守基序;编码蛋白均为不稳定蛋白,主要分布于细胞核中;二级结构以无规则卷曲为主,无跨膜结构。系统进化树分析表明,萱草AP2/ERF可分为DREB、ERF、AP2、RAV与Soloist类AP2/ERF转录因子五个亚族,ERF亚族成员数量最多。本研究为进一步探究萱草AP2/ERF家族结构及生物学功能提供理论基础。
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