【摘 要】
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目的:运用小鼠基因转录本的全基因表达谱芯片,研究Pitx2基因静默前后胰腺上皮内瘤变(pancreatic intraepithelial neoplasia,PanIN)细胞下游基因表达谱的变化.方法:应用小鼠
【机 构】
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上海交通大学医学院附属瑞金医院消化内科,上海 200025
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目的:运用小鼠基因转录本的全基因表达谱芯片,研究Pitx2基因静默前后胰腺上皮内瘤变(pancreatic intraepithelial neoplasia,PanIN)细胞下游基因表达谱的变化.方法:应用小鼠全基因芯片检测Pitx2基因静默前后PanIN细胞基因表达谱的变化,并运用实时荧光定量多聚酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)对部分芯片结果进行验证.结果:根据基因芯片筛选出差异倍数3倍以上的差异表达基因共97条.其中上调58条,涉及细胞增殖的基因包括Rac1、Ccr1、Fut9、PPP3CA、Sox5、Bmp7、Chtf18、Btg4、Flt4、Dscaml1和Pftk1;涉及细胞转移的基因包括Sesn1、Rpl7a、PPP3CA、Sox5、Bmp7、PIK3C2G、Cxcl12、Btg4和Kcnj14.下调39条,涉及细胞增殖的基因包括PPP2R2A、Nav1、PPP2R3C、Katnb1、Gpbp1、Nat3、Tgm5和PRKRA;涉及细胞转移的基因包括PPP2R2A、Lce1c、Hcn1、PPP2R3C、Tbxas1、Chrna1、Frmd5和Cdh7.其余基因涉及细胞周期、细胞死亡调控、细胞黏附、细胞转录活性、细胞转移酶活性.通过实时定量PCR对部分基因进行验证,显示基因芯片的结果与实时定量PCR验证结果基本一致.结论:通过基因芯片技术筛选出Pitx2基因静默前后PanIN细胞下游差异表达基因,为后续体内、外实验奠定了良好的基础.
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