【摘 要】
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新疆地处我国西北边境,与多国相邻,同时生活着种类繁多和数量庞大的啮齿动物.新疆也是多种人兽共患病的自然疫源地,然而该地区啮齿动物携带病毒的本底数据还十分欠缺.本研究
【机 构】
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扬州大学兽医学院 扬州225009;军事科学院军事医学研究院军事兽医研究所吉林省人兽共患病防控重点实验室 长春130122;石河子大学动物科技学院,石河子832003;军事科学院军事医学研究院军事兽医
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新疆地处我国西北边境,与多国相邻,同时生活着种类繁多和数量庞大的啮齿动物.新疆也是多种人兽共患病的自然疫源地,然而该地区啮齿动物携带病毒的本底数据还十分欠缺.本研究对新疆喀什地区喜马拉雅旱獭肠道样品,通过宏转录组法(Meta-transcriptomics,MTT)、序列不依赖扩增法(Sequence-independent amplification,SIA)、宏基因组法(Metagenomics,MTG)和多重替代扩增法(Multiple displacement amplification,MDA)进行病毒组学分析,结果发现30个科的病毒;进一步比较发现,四种方法具有不同的病毒捕获效果,其中MDA适合DNA病毒组,MTT适合RNA病毒组,而SIA则非常适合全病毒组.本研究重点对星状病毒、甲型肝炎病毒、腺病毒、博卡细小病毒进行遗传进化分析,其中星状病毒、腺病毒都与已知病毒具有明显的遗传差异性,为病毒新种;而甲型肝炎病毒、博卡细小病毒与参考毒株差异较小;对7种病毒进行检测,揭示了该地区旱獭携带病毒的多样性和流行情况.本研究获得了新疆喀什地区旱獭肠道样品的病毒组信息,增强了对该动物携带病毒多样性的认识.
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