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《伤寒论》虽在绝大多数条文中提到“伤寒”、“中风”和“温病”等疾病名称，但却不讲“伤寒”之为病、“中风之为病”以及“温病之为病”，也不讲“寒邪之为病”、“风邪之为病”以及“温邪之为病”而提的是“三阳（太阳、少阳、阳明）之为病”和“三阴（太阴、少阴、厥阴）之为病”。三阳和三阴乃是指人体整体阴精阳气矛盾运动的六种生理状态，当它们“为病”时则转化为六种病理状态。这六种病理状态既不是外因也不是内因，而是内外因相互作用的结果。所以，伤寒论采取了“据证而辨”和“审证求因”的方法来诊治疾病，这是对《内经》辩证病因学思想