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华中农业大学食品科技系成立于1984年，是由原园艺系农产品储藏加工学科、畜牧兽医系动物营养专业和农机系机械工程等合并组建，1985年食品科学和动物营养两个专业开始招生。1987年动物营养专业调整到动物科技学院。2002年食品质量与安全专业获教育部批准并开始招生。2002年10月食品科技系更名为食品科学技术学院，组建食品化学与分子生物学系、食品安全与微生物系和食品科学与工程系等3个系。