【摘 要】
:
目的 以红花变豆菜Sanicula rubriflora新鲜叶片为试验材料,通过高通量测序手段,对其叶绿体基因组进行组装和序列特征分析,为进一步开展变豆菜属植物的进化和遗传发育提供指导方法。方法 实验流程按照Illumina公司提供的标准操作流程执行,包括样品质量检测、文库构建、文库质量检测和文库测序等流程,使用已报道的变豆菜Sanicula chinensis的叶绿体基因组作为参考序列,得到红花
【基金项目】
:
中央本级重大增减支项目:名贵中药资源可持续利用能力建设项目(2060302); 中药制药过程新技术国家重点实验室开放基金项目(SKL2020M0302);
论文部分内容阅读
目的 以红花变豆菜Sanicula rubriflora新鲜叶片为试验材料,通过高通量测序手段,对其叶绿体基因组进行组装和序列特征分析,为进一步开展变豆菜属植物的进化和遗传发育提供指导方法。方法 实验流程按照Illumina公司提供的标准操作流程执行,包括样品质量检测、文库构建、文库质量检测和文库测序等流程,使用已报道的变豆菜Sanicula chinensis的叶绿体基因组作为参考序列,得到红花变豆菜完整的叶绿体基因组序列并对其进行组装、特征序列分析和进化分析。结果 红花变豆菜叶绿体基因组具有典型的环状四分体结构,长度155 700 bp,包括1个大的单拷贝区(large single copy,LSC,85 979 bp),1个小的单拷贝区(small single copy,SSC,17 053 bp),1对相反的序列(inverted repeats sequence,IR,26 333 bp);共注释到130个基因,其中蛋白编码的基因86个,tRNA基因36个,rRNA基因8个,AT含量占叶绿体基因组的61.83%;共检测到1个正向长重复序列(forward repeat sequence),3个回文长重复序列(palindromic repeat sequence);此外,还检测到了168个简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)位点;与蛋白编码基因对应的密码子偏好使用A/T碱基,编码异亮氨酸的密码子(I)使用次数最高,编码半胱氨酸的密码子(C)使用次数最低;最后与7种已报道的伞形科植物叶绿体基因组和2个外类群物种通过最大似然法(maximum likelihood,ML)构建系统发育树,发现红花变豆菜与变豆菜和直刺变豆菜亲缘关系最为密切。结论 红花变豆菜的叶绿体基因组数据为伞形科植物研究提供了更为详细完善的资料,为该物种叶绿体基因工程和系统进化分析提供参考依据。
其他文献
我国轨道交通快速发展,对轨道交通信号专业人才需求不断提高,许多院校纷纷建设轨道交通信号相关专业。随着专业的建设和发展,实训设备和实训基地缺乏,师资力量不足,成了困扰院校及相关专业教师的难题,加强校企合作,建立轨道交通信号实训室,解决这一难题刻不容缓。近年来,随着轨道交通信号实训室项目的增多,在实训室建设中的质量管理问题凸显。实训室质量的好坏不仅影响院校的实训教学质量、人才培养质量,也会对城市建设的
GFRP锚杆锚固是岩土工程加固的重要途径之一,锚固结构的安全可靠性受所处环境与施工质量影响,易发生锚固体损伤与GFRP锚杆损伤。对GFRP锚杆锚固结构进行实时无损检测是保障工程结构安全的关键问题之一,也是当前研究的热点和难点问题。压电智能材料具有灵敏度高、频率响应宽、驱动传感双重功能、稳定性好等特征,压电主动传感检测技术是结构安全检测的有效手段。采用理论分析、数值仿真、数值模拟、试验研究、信号处理
“风险评估和减轻策略”是美国FDA用于管理与药品相关的已知或潜在的严重风险的一项程序,以确保药物的获益大于其风险。嵌合抗原受体T细胞(CAR-T)疗法因其突出的疗效,为肿瘤患者带来了治疗新希望和新选择,但是由于其治疗原理的特性,目前几乎所有CAR-T细胞治疗都可能导致一些不良反应,其中以细胞因子释放综合征和神经毒性最为常见。本文拟通过探究美国CAR-T类药品风险管理策略中关于风险评估和减轻策略的内
公共租赁住房存在的意义在于其满足中低收入住房困难群体过渡性的住房需求,而其退出机制的存在则保证了公共物品的有效利用,达到“住房过滤”的目的。深圳是我国最早进行公共租赁住房制度试点的城市之一,尽管目前深圳公租房制度已经愈加完善,但是其公租房退出机制中的退出办法、动态监管规定和道德风险约束手段还存在一些问题,进而对公租房分配的有效性和公平性产生了一定程度的影响。笔者对深圳市公租房退出机制存在的问题及产
随着教育体制的改革,各学科的教育理念和教学方式也在发生改变,PBL项目式教学法是教育系统与时俱进的代表,对于帮助教师营造学习情境、引导学生掌握学习方法和学习思路起到了重要作用,并且在提升学生学科核心素养、培养学生终身学习习惯方面有着重要意义。本文阐述了PBL项目式教学法的概念和应用优势,并结合教学案例对其在小学科学教学中的应用策略进行了细致分析。
共同富裕是社会主义的本质要求,是中国式现代化的重要特征。中国特色社会主义进入新发展阶段,适应我国社会主要矛盾的变化,更好满足人民日益增长的美好生活需要,必须扎实推进共同富裕。当前,我国区域和城乡发展的不平衡、不协调、不充分等问题依然突出,区域经济差距和城乡收入差距仍然是影响我国共同富裕进程的重要因素。财政作为国家治理的基础和重要支柱,不仅在优化资源配置、维护市场统一、促进社会公平、实现国家长治久安
为研究方形基坑尺寸效应对长短桩围护结构支护效果的影响,以某桥梁承台基坑为依托,采用数值分析手段,通过现场实测对选用参数进行验证,依托选用参数拟定不同平面尺寸计算工况,通过地层应力与桩后土压力变化分析其尺寸效应;通过对比长短桩围护结构与等长桩围护结构的变形受力差异,探明尺寸效应对长短桩围护结构支护效果的影响。研究表明:当方形基坑尺寸较小时,在坑边一定距离处会形成连续、封闭的“类圆形”拱区域,存在与圆
当代世界风云变幻,国际国内局势正发生着极具复杂性、深刻性且颠覆性的变动。随着第四次工业革命浪潮的掀起,国际竞争日趋激烈,各国在政治、文化等意识形态领域的竞争在综合国力竞争中的地位逐渐提升,能否取得意识形态领域斗争的胜利关系到我国发展全局。进入新时代,习近平总书记在社会主义建设发展五百年的不朽历史中研悟意识形态思想、汲取建设经验,并结合新时代我国工作的实践经验,以宏阔高远的视野和超乎常人的政治勇气提
在当今社会发展迅速的今天,建筑工程在推动社会发展、推动经济发展、推进城市化进程中起着举足轻重的作用。安全施工是建筑事业发展的关键环节,其管理工作以实施现场建设、监理管理为主,要把“安全第一”的思想贯彻到各个单位,并坚持以“预防为主”的原则,特别是安全监理工程师,要从源头上进行安全管理,保证选拔施工人员素质过硬,安全管理到位。在建筑行业中,安全是建筑质量、速度、发展的根本,也是建筑企业的最佳名片。安