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集美大学生物工程学院成立于2001年2月。其前身是创办于1972年的厦门水产学院食品工程系。自1972年以来。学院共培养各类毕业生2400多人。现设有食品科学硕士学位授予点和食品科学与工程、生物工程、环境工程三个本科专业。2004年在校学生827人，其中食品科学与工程研究生8人、食品科学与工程专业351人，生物工程专业315人、环境工程专业153人。