花生EST资源的SSR信息分析

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微卫星或简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)存在于表达序列标签(expressed sequencetags,ESTs)中。为了在花生中开发EST—SSR功能性标记,利用生物信息学对NCBI公共数据库中的41501条花生ESTs序列进行EST—SSRs特征分析。剔除冗余序列,得到全长为5125.94kb的无冗余EST8391条。在这些序列中搜索出1109个SSR,分布于946条EST中,出现频率是11.27%。这些EST—SSR的平均长度为18.16bp,平均分布频率1/
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