目的：探讨硫酸类肝素蛋白多糖（ SDC2）基因遗传变异与接受单纯放疗的食管鳞癌患者总生存时间和放射性食管炎发生风险的关系。方法应用Sequenom Mass ARRAY平台检测296例接受单纯放疗的食管鳞癌患者SDC2基因功能区11个标签SNP位点的基因型，并分析其与患者总生存时间和放射性食管炎发生风险之间的关系。以非条件Logistic回归模型计算各基因型校正性别、年龄、肿瘤部位、肿瘤分期、放疗方式、总放疗剂量后的OR及其95％CI，以Cox比例风险回归模型计算HR及其95％CI。结果截至2014年6月，全组死亡260例（87．8％），生存36例。全组患者的中位生存时间为14个月。生存分析的结果显示，Ⅱ期和Ⅳ期患者的中位生存时间分别为19和10个月，Ⅳ期患者的预后比Ⅱ期患者差，HR为1．97（95％CI为1．34～2．89，P＜0．001）；总放疗剂量≥60 Gy和＜60 Gy患者的中位生存时间分别为17和10个月，总放疗剂量≥60 Gy患者的预后较好，HR为0．64（95％CI为0．49～0．84，P＝0．001）。与携带rs61599409 C等位基因患者比较，携带T等位基因患者的死亡风险有降低的趋势，校正HR为0．82（95％CI为0．66～1．02），但差异无统计学意义（P＝0．071）。未发现其他10个标签SNP位点与食管鳞癌患者放疗后的总生存时间相关。296例患者中，发生放射性食管炎160例，其中1级80例，2级66例，3级14例。位于SDC2基因3′非翻译区rs17788084位点与放射性食管炎的发生显著相关，与携带AA基因型比较，携带AT或TT基因型的患者发生放射性食管炎的风险显著降低（OR为0．48，95％CI为0．28～0．85，P＝0．011）。结论 SDC2 rs17788084遗传变异是影响食管鳞癌患者放疗副反应差异的重要因素，具有成为食管鳞癌个体化放射性损伤标志物的潜在应用价值。