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提升高等工程教育质量是我国加快建设世界科技强国的重要途径.以我国97所“双一流”建设高校为样本,采用结构化访谈、德尔菲法和专家打分法筛选出核心指标并确定指标权重,初步构建了由4个一级指标、15个二级指标构成的多元分类模式的高等工程教育评价指标体系,其中工科优势高校侧重“创新产出”、综合型高校侧重“研究质量”、地方性高校侧重“教学质量”和服务地方的“创新产出”.研究结果显示,高质量的人才培养是我国各类高校的核心工作,但在创新产出、满足国家重大战略需求及产业需求上存在明显不足.基于此,提出构建中国特色多元分类的工程教育评价指标体系和“使命导向”的高校创新产出评价指标体系等对策建议.