猪瘟病毒石门株NS2-3基因片段的序列测定及比较

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根据猪瘟病毒C株的序列,以计算机辅助设计,化学合成1对引物(PF 5648/PR 6604),应用RT-PCR技术从感染猪血中成功地扩增了我国猪瘟病毒强毒石门株NS2-3基因片段,大小为957 bp,位于NS3基因的中部NTPase和Helicase活性区.克隆后测序,结果表明该段基因产物具有解旋酶超家族全部七个特征性保守序列,包括共同的NTP结合基序A位点(GXGKT/S)和B位点(3 hy,2 x)D.序列同源性比较表明,石门株与日本的ALD和GPE-株同源性最高,与其它3株猪瘟病毒(C株、Brescia株和Alfort株)的同源性也很高,并与2株牛病毒性腹泻病毒(BVDV)(NADL株和SD-1株)也有较高的同源性,尤其是由核苷酸序列推导的氨基酸序列,同源性均大于90%,是瘟病毒属基因组中最保守的区段,这与该基因产物在病毒复制及聚蛋白前体加工过程中所具有的重要功能是一致的.
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