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基于“制度是重要的”和“金融支持是高新技术产业发展不可或缺的制度安排”这两个理论论断，本文采用制度经济学的分析方法，比较分析了中日高新技术产业发展金融支持制度安排及其变迁的制度环境、制度选择、制度运作与发展趋势等方面的特点，并探讨其存在差异的可能原因。当然，基于金融支持的内在基础与高新技术产业发展的外部环境发生根本性的变化时，金融支持制度的转型也就成为一种必然；两国的经济结构性条件也说明了金融支持制度的转型面临着方向确定以及路径抉择等方面的困境，因而必将是一个长期性和艰巨性的过程。