林中森出任台湾海基会董事长还不到20天，便于10月16日率团访问大陆，进行为期6天的“精进之旅”。这不仅是林中森履新后的首次访问，也是他的第一次大陆行。
　　此前，林中森对大陆并不熟悉。马英九说，他在两岸工作方面是“一张白纸”。林中森也坦承对两岸领域“确实有点陌生”。前董事长江丙坤曾建议林中森，上任后要多带团去大陆访问，看看台商在大陆的发展，这样可以很快进入状态。为此，上任之初，林中森就要求海基会尽快安排访问事宜，弥补自己的缺憾，这才有了这次大陆行。
　　6天的“精进之旅”
　　林中森将此次访问定义为“精进之旅”，是希望海基会和海协会在既有的良好基础上，能够求其精进，两岸关系能“百尺竿头，更进一步”。因此在行程安排上也相当紧凑，体现了“精致稳进”之意。
　　此次访问的第一站是北京。16日下午，林中森率领的海基会文化经贸参访团一下飞机，便直奔香山碧云寺拜谒孙中山先生衣冠冢，向这位中国国民党的创始人表达崇敬之意。林中森先向寺内孙中山铜像敬献了花圈，并率众三鞠躬。礼毕后，他瞻仰了孙中山水晶棺，还认真地阅读了纪念堂上的“孙中山致苏联遗书”。随后，林中森观看了有关的史迹影片，然后踏上台阶来到金刚宝座塔内的孙中山衣冠冢前，行鞠躬礼。谈到拜谒的感想，林中森说，献花时，他从心灵深处，默默祈求一代伟人孙中山能够庇佑世界大同，两岸和平、稳定、繁荣、发展，也庇佑两岸人民生活幸福、美满平安。
　　而接下来就是此次访问的“重头戏”。当天晚上和第二天，林中森分别会见了海协会会长陈云林、国台办主任王毅以及全国政协主席贾庆林。双方就两岸问题进行了交流。媒体注意到，此次会面都被安排在人民大会堂、钓鱼台国宾馆，接待规格相当高。这也显示了大陆对两岸两会交流的重视，有利于林中森了解大陆对台政策的方向和思路，增加对彼此的认识和互信。
　　10月18日，林中森一行到达湖北襄阳，登上襄阳古城，参访诸葛亮故居“古隆中”。次日，林中森参加“武当山兴建600周年系列纪念活动”。10月20日，林中森参访上海和昆山的台企，并与台商进行了座谈。10月21日，在参访了慧聚寺及台商大楼后，林中森搭机返回台北。“精进之旅”至此圆满完成。
　　这次访问，林中森感到收获颇丰。在参访期间，林中森多次讲到，依“先急后缓、先易后难、先经后政”的原则，把两岸关系再往前精进，以扩大成果、有所突破。林中森的这些观点得到大陆方面的积极回应。此外，林中森代表台湾方面提议两岸两会互设办事机构一事，也获得大陆方面积极善意的回应。
　　马英九为何选择林中森
　　海基会是台湾方面应对两岸关系最重要的机构，自1990年成立以来，一直是台湾方面处理两岸事务的第一线机构，具有无可代替的功能和地位，已成为两岸交流不可缺少的重要平台。而按照马英九的说法，林中森在大陆工作方面几乎是“一张白纸”。那马英九为何会选择林中森担任海基会董事长这一要职呢？
　　马英九说，选择林中森主要是着眼于他从事行政工作，对各部门的业务了如指掌，与各“部门首长”也非常熟识，同时与民意代表也都很熟悉，这些都是非常重要的条件。此外，马英九还认为，林中森“一张白纸，发挥的空间也更大”。
　　其实，林中森与马英九的副手吴敦义关系密切，这才是马英九任命他掌管海基会的重要原因。
　　今年68岁的林中森是台湾政治大学的法学博士。曾任高雄市政府秘书长、高雄市常务副市长、“内政部常务次长”、“内政部政务次长”、“行政院秘书长”、国民党秘书长等职。而在林中森的政治生涯中，他长年担任吴敦义的副手，两人合作近20年，深得吴敦义的信任，也被人称作“亲吴人士”。
　　林中森是吴敦义在高雄市长任内的秘书长与副市长。吴敦义出任“行政院长”，林中森随吴进入“行政院”，担任秘书长。林中森个性温和，人称“阿伯”。他能力强、行事低调、口风紧，始终扮演着称职的幕僚角色。作为吴敦义的秘书长，很少有民众叫得出林中森的名字。出席公开活动，他也不会发声，相当低调。林中森不仅做事专业，而且知道谨守分寸。出任“行政院秘书长”后，好几次研拟重大政策，风声传出，甚至连“行政院”发言人江启臣都去请示是否发布新闻，林中森仍坚持不到时候不能对外透露。
　　而在一些大事小情上，也能看出吴林二人关系不浅。2012年10月15日，林中森与媒体人士用餐时，有记者劝他喝酒，林中森谦称不胜酒力，并爆料以前都是吴敦义帮他挡酒。这也从侧面证明了林中森与吴敦义的关系密切。而当年，吴敦义担任高雄市长时，林中森曾受吴敦义之托勇闯钓鱼岛。1990年高雄市主办运动大会，必须全台绕境传递圣火，钓鱼岛也是规划的传递路线。原本市长吴敦义要亲自搭船去钓鱼岛，后因故只能由秘书长林中森代劳。林中森等人从宜兰县驾船直奔钓鱼岛。船只航行8个多小时后，先是遇到一架日本直升机及一架喷气式战斗机在空中盘旋，然后出现12艘日本舰艇将其团团围住，此时钓鱼岛主岛已在12海里范围内，肉眼清晰可见，气氛相当紧张。由于渔船设备不佳，林中森等人的船只在与日本军舰对峙了一整天后，才依指示返回台湾。
　　两人先后访问不是巧合
　　10月4日至8日，民进党前主席谢长廷访问大陆后，在台湾政坛掀起阵阵涟漪，不仅民进党内部议论纷纷、热闹非凡，国民党也感受到一定的压力。如果说林中森上任不久后便赴大陆访问与谢长廷的访问是巧合，那显然是自欺欺人。
　　据台湾媒体报道，林中森原计划在11月8日中共十八大召开之后，再出访大陆。谢长廷访问大陆后，林中森便根据上层指示，将此次大陆之行的时间提前。
　　在短短一个月内，谢长廷和林中森分别作为民进党和国民党的标志性人物访问大陆，实际上造成了两党在大陆政策方面的博弈。尽管民进党内对谢长廷访问大陆还有一些批评的声音，但大多数台湾民众的态度是支持的，民进党内也有很多理性的声音支持谢长廷。这一形势不仅对民进党大陆政策改弦易辙产生了一定的冲击和压力，在很大程度上也对国民党进一步推进大陆政策产生了巨大压力。如果民进党和国民党这两个岛内主要政党能够借林中森、谢长廷访问大陆之机，在对大陆政策方面形成一种良性的相互促进，那将是两岸民众之福。进一步讲，如果国民党、民进党都能与大陆形成良性互动，那将能够为两岸关系和平发展开创一个崭新的局面，把两岸关系推向新的高度。