【摘 要】
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为研究栀子中环烯醚萜类物质生物合成的分子机制,本研究以药用植物栀子果实为研究材料,利用Illumina HiSeq 4000对栀子进行转录组测序,利用Trinity软件对测序结果进行De novo
【机 构】
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重庆市中药研究院,中国中医科学院中药资源中心重庆分中心,重庆市中药良种选育与评价工程技术研究中心,重庆,400065
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为研究栀子中环烯醚萜类物质生物合成的分子机制,本研究以药用植物栀子果实为研究材料,利用Illumina HiSeq 4000对栀子进行转录组测序,利用Trinity软件对测序结果进行De novo组装,使用BLAST软件对Unigene进行分类、功能注释,通过MISA软件分析SSR位点.共组装获得75 539条Unigene,平均长度1 614 bp,在数据库的注释成功率为100%,共搜索到50 571个SSR位点,发现栀子转录组中有1 294个Unigene参与到16个与栀子次生代谢物质生物合成的代谢通路中,其中有77个参与环烯醚萜类物质生物合成.本研究初步获得栀子中参与环烯醚萜类物质合成的功能基因,不仅为开展栀子功能基因的鉴定和克隆提供基础序列,还为后续开展栀子药效成分生物合成的分子机制提供依据.
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