麻疯树胚乳ESTs序列的克隆和生物信息学初步分析

来源 :四川大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户：qq447105111

【摘要】

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基于Linux操作系统，利用Phrap／Consed、cross_match、blast等软件和自主开发程序，构建了批量ESTs序列的检测系统，对麻疯树胚乳cDNA文库部分测序结果进行生物信息学分析，包括载体序

【作者】

：

熊瑛朱勋路徐莺蔡浩洋陈放

【机构】

：

四川大学生命科学学院

【出处】

：

四川大学学报(自然科学版)

【发表日期】

：

2009年4期

【关键词】

：

麻疯树 EST数据生物信息学 GO(Gene Ontology) Jatropha curcas L. EST data bioinformatics

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基于Linux操作系统，利用Phrap／Consed、cross_match、blast等软件和自主开发程序，构建了批量ESTs序列的检测系统，对麻疯树胚乳cDNA文库部分测序结果进行生物信息学分析，包括载体序列的去除、序列格式的转换、重复序列鉴定、序列的同源性比对、GO生物学过程以及GO细胞组分分类．

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