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辣椒的病害主要有疫病、病毒病、炭疽病、白绢病、茶黄螨。虫害有小地老虎、烟青虫等。
1.病毒病
辣椒病毒病常见的有花叶、畸形、条斑等症状。后期植株上部明显丛簇状，节间缩短，植株矮化，造成落叶、落花，以至整株枯死。
防治方法：（1）选用抗病品种，早熟品种一般比晚熟品种抗病或耐病。如中椒2号，中椒6号、百耐尖椒、湘椒13号、苏椒5号等。（2）种子消毒。用10%磷酸三钠溶液浸种20分钟，清水洗净后再进行浸种催芽。（3）栽培管理。实行轮作和短畦垄作，采用薄膜覆盖栽培，培育健壮植株、根系发达、抗病力增强，使其早定植、早结果，清除田间路边杂草，减少病毒来源。（4）药剂防治。防治蚜虫，可用25%扑虱蚜可湿性粉剂2000倍喷洒。发病初期喷洒20%病毒A可湿性粉剂500倍液，50%菌毒清200倍液。幼苗期或定植后每隔10天喷施一次，连续防治3～4次，起到控制病情发展的作用。
2.炭疽病
果实和叶片均可受害，以成熟果实及老叶受害最烈。病斑褐色，水浸状，长圆形或不规则形，凹陷。有稍隆起的同心轮纹斑，其上生有很多黑色小点，周缘有湿润性的变色圈。
防治方法：（1）选用无病种子，实行3年以上的轮作制度，加强田间管理，合理施肥，以提高作物的搞病力。（2）在田间出现部分辣椒果开始成熟着色时，可用1：1：200波尔多液或70%可湿性甲基托布津1000-1500倍液或75%可湿性百菌清600倍液防治，每7-10天喷1次，连喷2-3次。
3.疫病
叶片染病，叶片上出现暗绿色圆形病斑，边缘不明显，潮湿时，其上可出现白色霉状物，病斑扩展迅速，叶片大部软腐，易脱落，干后成淡褐色。茎部染病，出现暗褐色条状病斑，边缘不明显，条斑以上枝叶枯萎，病斑呈褐色软腐，潮湿时斑上出现白色霉层。果实染病，病斑呈水渍状暗绿色软腐，边缘不明显，潮湿时，病部扩展迅速，可全果软腐，果上密生白色霉状物，干燥后变淡褐色、枯干。
防治方法：（1）实行轮作、深翻改土，选用抗病品种，种子严格消毒，培育无菌壮苗，全面覆盖地膜，加强通气，（2）注意观察，发现少量发病叶果，立即摘除深埋。（3）在化学防治上，定植前要搞好土壤消毒，结合翻耕，每亩喷洒3000倍96%天达恶霉灵药液50千克，或撒施70%敌克松可湿性粉剂2.5千克，杀灭土壤中残留病菌。定植后，每10——15天喷洒一次1：1：200倍等量式波尔多液，进行保护，防止发病。
4.茶黄螨
茶黄螨发育适温16～28℃，成螨和幼螨多聚集在辣椒幼嫩的新叶叶背、嫩茎、花蕾、幼果等部位刺吸汁液，致使植株受害。受害叶片背面呈灰褐色或黄褐色并有油浸状光泽，叶缘向背面卷曲，形成下扣斗。花蕾和幼果受害则不开花或开畸形花。果实受害，果柄及萼片表面呈灰白色至灰褐色，受害严重时，落花、落叶、落果、造成大面积减产。
防治方法：发现有此螨发生应立即进行药剂防治，可用15%哒螨酮乳油3000倍液、34%螨虫立克乳油2000～2500倍液、48%乐斯本1000倍液、10%除尽3000倍液、1.8%集琦虫螨克或1.8%阿维菌素（齐螨素、新科等）3000倍液进行防治。注意，防治螨虫时不能使用三氯杀螨醇。
5.白绢病
发病部位主要在近地面的茎基部和地下根部。病株最初在靠近地面的茎部产生暗褐色病斑，病部健部交界处明显，最下部的几片叶片开始变黄或萎蔫。其后，茎部病斑表面布满由白色菌丝体形成的绢丝状霉层，故称白绢病。并呈放射状向上发展，也迅速向下扩展侵入根部，引起腐烂，最后全株枯死。
防治方法：（1）3年以上轮作；结合整地深耕，每亩撒石灰粉50～100Kg，用腐熟的有机肥作底肥；.及时拔除中心病株，穴内撒石灰粉消毒。（2）用五氯硝基苯与细土（1：100）拌匀后配成药土，撒施在植株地面茎基部及周围地面上，每亩用药土50-75公斤。（3）用5%的石灰水或50%的代森铵800～1000倍液浇根，防病效果较好。
6.小地老虎又叫切根虫、地蚕。以幼虫为害，主要危害辣椒的幼苗，切断幼苗近地面的茎部，使整株死亡，造成缺苗断垅，甚至毁种。
防治方法 （1）利用糖醋液和黑光灯诱杀成虫，利用泡桐叶诱杀幼虫。 （2）药剂防治 在下午5时前后用90%敌百虫800倍液喷洒。
7.烟青虫
以幼虫蛀食花蕾、花、果，也食害嫩茎、叶和芽。被蛀果实引起腐烂而大量落果，是造成减产的主要原因。当辣椒现蕾开花时，成虫在嫩叶、嫩茎和花蕾上产卵，初孵幼虫为害嫩叶、嫩茎，使之呈现小孔，幼虫稍大时，即吐丝下垂分散为害，并蛀入幼果内取食果肉、胎座，排出粪便，引起果实腐烂。虫害发生盛期为7～9月。
防治方法：在现蕾开花时及时用氯氰菊酯乳油1000倍液，或敌杀死16mL对水15kg喷雾，或90%晶体敌百虫800倍液喷雾；间隔15～20d再喷雾1次，连续2～3次。进入采收期则用阿维菌素1500～2000倍液喷雾。生产中，注意交替用药，以免害虫产生抗性。禁止使用高毒、高残留、高生物富集性农药，同时注意农药使用安全间隔期，一般低毒农药施用后7～10d才可采摘。
8.蚜虫
1年发生15～25代，适温（<28 ℃）、干燥有利于其发生，应掌握早治原则。用银灰色地膜覆盖，避蚜效果明显。人工饲养瓢虫、蜘蛛、草蛉等，释放于椒田。生物防治。用80～1 000 mg/kg庆丰霉素喷雾。药剂防治。用50%敌敌畏1 000倍液、70%杀蚜粉2 000倍液、2.5%敌杀死3 000倍液、50%抗蚜威可湿性粉2 000倍液、21%灭杀毙3 500倍液防治。
9.蝼蛄、蛴螬
9.1毒谷诱杀。小米或玉米5 kg，水煮半熟，稍晾干，互不粘着，拌入90%敌百虫120倍液0.20～0.25 kg，搅匀晾至7成干使用，一般用毒谷22.5～37.5 kg/hm2，可施入土内或土表，也可与种、苗混合。
9.2毒饵诱杀。用麦麸5 kg，喷入90%敌百虫30倍液至手捏成团，一觸即散时可用，于灌水或雨后傍晚撒于苗、株附近地面，用量22.5～37.5 kg/hm2。
1.病毒病
辣椒病毒病常见的有花叶、畸形、条斑等症状。后期植株上部明显丛簇状，节间缩短，植株矮化，造成落叶、落花，以至整株枯死。
防治方法：（1）选用抗病品种，早熟品种一般比晚熟品种抗病或耐病。如中椒2号，中椒6号、百耐尖椒、湘椒13号、苏椒5号等。（2）种子消毒。用10%磷酸三钠溶液浸种20分钟，清水洗净后再进行浸种催芽。（3）栽培管理。实行轮作和短畦垄作，采用薄膜覆盖栽培，培育健壮植株、根系发达、抗病力增强，使其早定植、早结果，清除田间路边杂草，减少病毒来源。（4）药剂防治。防治蚜虫，可用25%扑虱蚜可湿性粉剂2000倍喷洒。发病初期喷洒20%病毒A可湿性粉剂500倍液，50%菌毒清200倍液。幼苗期或定植后每隔10天喷施一次，连续防治3～4次，起到控制病情发展的作用。
2.炭疽病
果实和叶片均可受害，以成熟果实及老叶受害最烈。病斑褐色，水浸状，长圆形或不规则形，凹陷。有稍隆起的同心轮纹斑，其上生有很多黑色小点，周缘有湿润性的变色圈。
防治方法：（1）选用无病种子，实行3年以上的轮作制度，加强田间管理，合理施肥，以提高作物的搞病力。（2）在田间出现部分辣椒果开始成熟着色时，可用1：1：200波尔多液或70%可湿性甲基托布津1000-1500倍液或75%可湿性百菌清600倍液防治，每7-10天喷1次，连喷2-3次。
3.疫病
叶片染病，叶片上出现暗绿色圆形病斑，边缘不明显，潮湿时，其上可出现白色霉状物，病斑扩展迅速，叶片大部软腐，易脱落，干后成淡褐色。茎部染病，出现暗褐色条状病斑，边缘不明显，条斑以上枝叶枯萎，病斑呈褐色软腐，潮湿时斑上出现白色霉层。果实染病，病斑呈水渍状暗绿色软腐，边缘不明显，潮湿时，病部扩展迅速，可全果软腐，果上密生白色霉状物，干燥后变淡褐色、枯干。
防治方法：（1）实行轮作、深翻改土，选用抗病品种，种子严格消毒，培育无菌壮苗，全面覆盖地膜，加强通气，（2）注意观察，发现少量发病叶果，立即摘除深埋。（3）在化学防治上，定植前要搞好土壤消毒，结合翻耕，每亩喷洒3000倍96%天达恶霉灵药液50千克，或撒施70%敌克松可湿性粉剂2.5千克，杀灭土壤中残留病菌。定植后，每10——15天喷洒一次1：1：200倍等量式波尔多液，进行保护，防止发病。
4.茶黄螨
茶黄螨发育适温16～28℃，成螨和幼螨多聚集在辣椒幼嫩的新叶叶背、嫩茎、花蕾、幼果等部位刺吸汁液，致使植株受害。受害叶片背面呈灰褐色或黄褐色并有油浸状光泽，叶缘向背面卷曲，形成下扣斗。花蕾和幼果受害则不开花或开畸形花。果实受害，果柄及萼片表面呈灰白色至灰褐色，受害严重时，落花、落叶、落果、造成大面积减产。
防治方法：发现有此螨发生应立即进行药剂防治，可用15%哒螨酮乳油3000倍液、34%螨虫立克乳油2000～2500倍液、48%乐斯本1000倍液、10%除尽3000倍液、1.8%集琦虫螨克或1.8%阿维菌素（齐螨素、新科等）3000倍液进行防治。注意，防治螨虫时不能使用三氯杀螨醇。
5.白绢病
发病部位主要在近地面的茎基部和地下根部。病株最初在靠近地面的茎部产生暗褐色病斑，病部健部交界处明显，最下部的几片叶片开始变黄或萎蔫。其后，茎部病斑表面布满由白色菌丝体形成的绢丝状霉层，故称白绢病。并呈放射状向上发展，也迅速向下扩展侵入根部，引起腐烂，最后全株枯死。
防治方法：（1）3年以上轮作；结合整地深耕，每亩撒石灰粉50～100Kg，用腐熟的有机肥作底肥；.及时拔除中心病株，穴内撒石灰粉消毒。（2）用五氯硝基苯与细土（1：100）拌匀后配成药土，撒施在植株地面茎基部及周围地面上，每亩用药土50-75公斤。（3）用5%的石灰水或50%的代森铵800～1000倍液浇根，防病效果较好。
6.小地老虎又叫切根虫、地蚕。以幼虫为害，主要危害辣椒的幼苗，切断幼苗近地面的茎部，使整株死亡，造成缺苗断垅，甚至毁种。
防治方法 （1）利用糖醋液和黑光灯诱杀成虫，利用泡桐叶诱杀幼虫。 （2）药剂防治 在下午5时前后用90%敌百虫800倍液喷洒。
7.烟青虫
以幼虫蛀食花蕾、花、果，也食害嫩茎、叶和芽。被蛀果实引起腐烂而大量落果，是造成减产的主要原因。当辣椒现蕾开花时，成虫在嫩叶、嫩茎和花蕾上产卵，初孵幼虫为害嫩叶、嫩茎，使之呈现小孔，幼虫稍大时，即吐丝下垂分散为害，并蛀入幼果内取食果肉、胎座，排出粪便，引起果实腐烂。虫害发生盛期为7～9月。
防治方法：在现蕾开花时及时用氯氰菊酯乳油1000倍液，或敌杀死16mL对水15kg喷雾，或90%晶体敌百虫800倍液喷雾；间隔15～20d再喷雾1次，连续2～3次。进入采收期则用阿维菌素1500～2000倍液喷雾。生产中，注意交替用药，以免害虫产生抗性。禁止使用高毒、高残留、高生物富集性农药，同时注意农药使用安全间隔期，一般低毒农药施用后7～10d才可采摘。
8.蚜虫
1年发生15～25代，适温（<28 ℃）、干燥有利于其发生，应掌握早治原则。用银灰色地膜覆盖，避蚜效果明显。人工饲养瓢虫、蜘蛛、草蛉等，释放于椒田。生物防治。用80～1 000 mg/kg庆丰霉素喷雾。药剂防治。用50%敌敌畏1 000倍液、70%杀蚜粉2 000倍液、2.5%敌杀死3 000倍液、50%抗蚜威可湿性粉2 000倍液、21%灭杀毙3 500倍液防治。
9.蝼蛄、蛴螬
9.1毒谷诱杀。小米或玉米5 kg，水煮半熟，稍晾干，互不粘着，拌入90%敌百虫120倍液0.20～0.25 kg，搅匀晾至7成干使用，一般用毒谷22.5～37.5 kg/hm2，可施入土内或土表，也可与种、苗混合。
9.2毒饵诱杀。用麦麸5 kg，喷入90%敌百虫30倍液至手捏成团，一觸即散时可用，于灌水或雨后傍晚撒于苗、株附近地面，用量22.5～37.5 kg/hm2。