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测定了蜂猴属线粒体DNA中的D-loop控制区部分序列和细胞色素b基因全序列（1140 bp），对其变异情况进行了分析，并采用Mega 4.0软件中构建了分子系统树。无论是基于D-loop控制区部分序列构建的系统树，还是基于细胞色素b基因序列构建的分子系统树的拓扑结构图，都清晰地表明蜂猴属由两个分支组成，分支置信度较高，一支由N．pygmaeus聚成，另一支由N．coucang聚成，即支持蜂猴属由N．coucang和N．pygmaeus两物种组成。