【摘 要】
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目的 建立一种基于核糖体基因内间隔区(IGS)的多重聚合酶链反应(PCR),用于快速鉴定新生隐球菌新生变种、格鲁比变种和格特隐球菌.方法 选取新生隐球菌和格特隐球菌IGS中变异度最高的Ⅰ区(IGSl)为靶点,经ClustalW2多重比对,并结合Olig06软件在不同序列位点设计针对新生隐球菌新生变种、格鲁比变种和格特隐球菌的引物用于多重PCR分析.通过51株新生隐球菌(VNⅠ-VNⅣ和VNB基因型
【机 构】
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200092上海交通大学医学院附属新华医院皮肤科,200092上海交通大学医学院附属新华医院皮肤科,同济大学环境科学与工程学院,同济大学环境科学与工程学院,复旦大学遗传所遗传工程国家重点实验室,200
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目的 建立一种基于核糖体基因内间隔区(IGS)的多重聚合酶链反应(PCR),用于快速鉴定新生隐球菌新生变种、格鲁比变种和格特隐球菌.方法 选取新生隐球菌和格特隐球菌IGS中变异度最高的Ⅰ区(IGSl)为靶点,经ClustalW2多重比对,并结合Olig06软件在不同序列位点设计针对新生隐球菌新生变种、格鲁比变种和格特隐球菌的引物用于多重PCR分析.通过51株新生隐球菌(VNⅠ-VNⅣ和VNB基因型)和41株格特隐球菌(VGⅠ-VGⅣ基因型)对该方法进行验证,并将该方法与已报道的CGB显色培养和采用特异性引物GPA1A、CLA4D和SOD1 gattii扩增格鲁比变种、新生变种和格特隐球菌的单一引物PCR方法进行比较.结果 基于IGS的多重PCR分析成功鉴定所有92株新生隐球菌和格特隐球菌,对其他常见致病酵母的扩增均阴性,显示所设计引物较高的特异性；已报道的基于GPA1A和CLA4D引物PCR分别在鉴定2株和1株格特隐球菌时出现假阳性结果；CGB培养基在鉴定1株格鲁比变种和1株新生变种时出现假阳性结果.上述方法在鉴定时均未出现假阴性结果.结论 建立的多重PCR可快速准确地鉴定新生隐球菌新生变种、格鲁比变种、AD杂合子和格特隐球菌,且优于已报道的单一引物PCR或CGB显色培养法。
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