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根据曼陀罗属核糖体基因转录间隔区(ITS)序列设计通用引物,得到33个不同来源的曼陀罗属植物的ITS序列,并以小天仙子(Hyoscyamus bohemicus)为外群,应用遗传距离与系统树分析法对曼陀罗属植物之间的分类进行了初步探讨。结果表明:在供试样品中,紫花曼陀罗(Datura tatula)和曼陀罗(Daturastramonium)的ITS序列完全相同;多刺曼陀罗(Datura ferox)、栎叶曼陀罗(Datura quercifolia)和曼陀罗(Datura stramonium)之间的亲缘关系很近;紫花曼陀曼(Datura tatula)、曼陀罗(Datura stramonium)、无刺曼陀罗(Datura inermis)和光滑曼陀罗(Datura laevis)4个种间不存在遗传距离;传统分类中曼陀罗属的Dutra亚属内除光曼陀罗(Datura leichhardtii)和异色曼陀罗(Datura discolor)在ITS序列表现为比较独立的2个种外,其他各种间的亲缘关系也较近;在ITS序列上湿地曼陀罗(Datura ceratocaula)与曼陀罗(Daturastramonium)没有差异。