基于双重索引矩阵的蛋白质功能预测

来源 :计算机应用 | 被引量 : 4次 | 上传用户：tyllr82

【摘要】

：

针对单一数据源预测蛋白质功能效果不佳以及蛋白质相互作用网络信息不完全等问题,提出一种多数据源融合和基于双重索引矩阵的随机游走的蛋白质功能预测(MSI-RWDIM)算法。该算法使用了蛋白质序列、基因表达和蛋白质相互作用数据预测蛋白质功能,并根据这些数据源特性构建相应的相互作用加权网络;然后融合各数据源加权网络并结合功能相关性网络构建双重索引矩阵,使用随机游走算法计算得分进而预测蛋白质功能。在酵母数据

【作者】

：

孟军张信

【机构】

：

大连理工大学计算机科学与技术学院

【出处】

：

计算机应用

【发表日期】

：

2015年06期

【关键词】

：

【基金项目】

：

国家自然科学基金资助项目;

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