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海洋中畸形波能够给船舶与海洋结构物带来巨大危害。准确地模拟特定畸形波列是研究其与结构物相互作用的基础。文章基于商业计算流体动力学软件FLUENT建立了一个数值波浪水池。通过线性聚焦方法给定一个畸形波时历,采用傅里叶分析来求解畸形波时历中每一个组成波的波幅和相位,提出了一种相位调制方法来提高模拟精度。将数值结果与物理水槽试验进行了对比,证明该相位调制方法能够显著提高数值模拟精度,展现了研究畸形波与结构物相互作用问题的新前景。