【摘 要】
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本研究对2009年实验室保存的一株Class Ⅰ新城疫病毒分离株NDV09-056的NP和P基因进行了扩增和序列分析,对其分子特征和遗传进化关系进行了分析.结果表明该分离株NP蛋白基因全
【机 构】
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中国动物卫生与流行病学中心,广西大学动物科学学院
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本研究对2009年实验室保存的一株Class Ⅰ新城疫病毒分离株NDV09-056的NP和P基因进行了扩增和序列分析,对其分子特征和遗传进化关系进行了分析.结果表明该分离株NP蛋白基因全长为1746nt,共编码489aa,其N端1~401孰基酸相对比较保守,C端402~479氛基酸变化比较大;同源性分析表明本分离株的NP蛋白基因与Ⅰ类新城疫病毒代表毒株之间核苷酸的同源性为93.5%~98.5%,而与Ⅱ类新城疫病毒代表毒株的同源性较低,介于77.0%~79.2%.P蛋白主要氛基酸突变区集中在57~107aa和135~212aa两个区域,而N端和C端相对保守;同源性分析表明本分离株的P蛋白基因与Ⅰ类新城疫病毒代表毒株之间核苷酸的同源性为90.4%~95.31%,而与Ⅱ类新城疫病毒代表毒株的同源性较低,介于68.3%~72.5%.遗传进化分析表明本分离株与I类基因3型新城疫病毒代表株NDV08-004的亲缘关系最近.
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