基于公共数据库牙鲆EST-SSR的开发及特征分析

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本研究对公共数据库中的15268条牙鲆EST序列进行处理和分析。在917条EST序列中查找到SSR,出现频率为12.6%,分布密度为1/5.7kb。优势重复基序为二核苷酸和三核苷酸重复,占63.5%和24.3%,并且分别以(AC)。重复(63.9%)和(AGC)。重复(15%)最多。基序重复次数以6次为最多,占24.0%。运用所得到的EST—SSR序列设计484对引物,经牙鲆群体验证,共获得了357对有效引物,占总引物数73.8%。研究结果为牙鲆及亲缘关系较近物种的EST.SSR标记的开发提供基础,同时也
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