【摘 要】
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目的克隆安徽省人乳头状瘤病毒16型(HPV16)全基因组,分析HPV16全基因组序列并了解其结构特征。方法收集5例安徽省宫颈癌病理组织标本并提取总DNA,设计4对特异性引物分段克隆H
【机 构】
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安徽医科大学第三附属医院合肥市第一人民医院口腔颌面外科,安徽农业大学植物保护学院
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目的克隆安徽省人乳头状瘤病毒16型(HPV16)全基因组,分析HPV16全基因组序列并了解其结构特征。方法收集5例安徽省宫颈癌病理组织标本并提取总DNA,设计4对特异性引物分段克隆HPV16全基因组,测序后进行序列拼接及核苷酸序列分析。结果检测到1个宫颈癌病理样本中含有HPV16并获得全基因组序列,序列全长7 906 nts(GenBank登录号:KC935953)。序列比对显示,安徽HPV16(HPV16-Anhui)与泰国HPV16和日本HPV16的全基因组核苷酸序列相似性最高,达99.5%。系统关系树分析显示,HPV16-Anhui与其他7个HPV16型聚成1个单独的分支。结论获得安徽省首例HPV16全基因组核苷酸序列,HPV16-Anhui与不同地区HPV16亲缘关系均较近且基因组变异性较小。
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