柚木CBF基因全基因组分析

来源 :分子植物育种 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tzhole
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热带珍贵树种柚木(Tectona grandis)是世界上主要造林树种,低温是影响其在我国扩大种植的重要因素。CBF (C-repeat binding factor)是植物抵御低温胁迫的一类重要转录因子。为了探究柚木CBF基因家族的生物学特性,在全基因组水平上对其成员进行了鉴定,推断了其编码蛋白理化性质、结构域,分析了其基因染色体定位以及启动子顺式作用元件。结果表明,柚木共鉴定出8个CBF基因家族成员,与拟南芥CBF基因家族基本一致,它们进一步可以分为两亚组。其编码蛋白长度从199~246 aa不等,分子量在20~30 kDa之间,全部为酸性亲水蛋白。蛋白质二级结构中无规则卷曲和α-螺旋所占比例较大,三级结构相似。亚细胞定位分析显示,8个CBF基因全部定位在细胞核上。柚木CBF基因家族成员分布于不同染色体上,启动子上游存在多种光响应、激素响应、逆境胁迫响应相关顺式作用元件。表达分析表明,在柚木中CBF基因参与多种生长发育过程,在多种组织中发挥功能。本研究不仅为深入了解CBF基因在柚木低温胁迫应答机理提供资料,也为柚木抗低温育种提供参考。
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