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核仁小分子RNA(snoRNA)是非编码RNA中研究得最多。了解得最详细的成员之一。依据snoRNA保守的序列和结构元件可将其分成三类:box C/D snoRNA。box H/ACA snoRNA以及MRPRNA。它们的主要功能分别为指导rRNA或snRNA中特异位点的2’-O-核糖甲基化修饰、假尿嘧啶化修饰或作为分子伴侣参与靶标RNA高级结构的形成。目前发现的snoRNA基因组织主要有四种形式:独立基因编码的snoRNA、内含子编码的snoRNA、多顺反子snoRNA基因簇和内含子编码的snoRNA基