【摘 要】
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对猪细小病毒自然弱毒N株（PPV—N株）VP1基因扩增及测序，利用生物信息学技术预测VP1蛋白的二级结构与B细胞抗原表位，以及分析该蛋白的氨基酸差异位点及密码子偏爱性。结果表明，PPV
【基金项目】
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广西科学基金项目（桂科自0728102）
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对猪细小病毒自然弱毒N株（PPV—N株）VP1基因扩增及测序，利用生物信息学技术预测VP1蛋白的二级结构与B细胞抗原表位，以及分析该蛋白的氨基酸差异位点及密码子偏爱性。结果表明，PPV—N株VP1基因与弱毒参考毒株NADL-2VP1基因同源性最高，亲缘关系最近。PPV—N株VP1蛋白的二级结构较为复杂，以β-折叠为主，并有较多的转角和无规则卷曲区域，在序列的20～56、61～80、86～130、136～188区域为B细胞抗原表位的优势区域。PPV强、弱毒株VP1蛋白存在5个氨基酸差异位点（T-365-I，
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