论文部分内容阅读
目的
阐明2013年青岛地区手足口病(HFMD)病原谱及肠道病毒71(EV71)型、柯萨奇病毒A16(CVA16)型和柯萨奇病毒A6(CVA6)型青岛分离株的基因特征。
方法用荧光RT-PCR法检测2013年青岛地区HFMD患者咽拭子标本中的总肠道病毒(EV)、EV71、CVA16和CVA6,对阳性分离株进行VP1基因全长序列扩增、基因序列测定及系统进化分析。
结果2013年共检测841个手足口病轻症病例和107个重症病例,肠道病毒阳性率64.3%,主要病原构成为EV71(44.8%)、CVA6(28.2%)和CVA16(9.5%)。CVA6超过CVA16成为手足口病的第二大致病原,占3岁以下儿童肠道病毒构成的42.7%,占重症病例分离病原的22.2%,在手足口病病原构成中所占比例随年龄增长呈下降趋势(P<0.001)。VP1全长的系统发生分析显示,2013年EV71属于C4基因亚型中的C4a,CVA16属于B1亚型的B1a和B1b,与其他地区同期参考株无明显差别;CVA6的VP1序列分为A~F 6个基因组,青岛地区CVA6分离株分处A和D基因组,2013年CVA6青岛分离株83.9%位于A基因组,16.1%位于D基因组;2012年CVA6青岛分离株66.7%位于A基因组,33.3%位于D基因组;2008—2011年CVA6青岛分离株全部位于D基因组。
结论EV71、CVA6和CVA16是2013年青岛地区手足口病的主要病原;CVA6所占病原构成随年龄增长呈下降趋势;EV71流行亚型为C4a,CVA16流行亚型为B1a和B1b;CVA6优势毒株在2008—2013年间显示出由D基因组向A基因组的改变。