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[学位论文] 作者:毛逸清,, 来源:中国人民解放军军事医学科学院 年份:2016
鼠疫耶尔森氏菌(Yersinia pestis)是一种能够引起致命全身感染的高危细菌,世界上曾发生过三次鼠疫大流行,死亡人数过亿。根据WHO的数据,仅2001-2015年间,全球就发生18次鼠疫...
[会议论文] 作者:毛逸清,赵东升, 来源:第十二届全国医药信息学大会 年份:2011
  面对基因组学等生物医学数据量的迅猛飙升,科研机构面临着巨大的数据存储和分析需求。云计算是网格计算、分布式计算和并行计算的发展,开源云系统在满足研究机构需求方面具......
[会议论文] 作者:王小磊,毛逸清,赵东升, 来源:第十一届全国医药信息学大会 年份:2008
现代生物医学研究极大地依赖于高性能计算系统。本文介绍了面向生物医学研究的高性能计算技术的国内外发展现状和基本方法,从生物医学研究需求和计算技术发展两方面探讨了目前......
[期刊论文] 作者:李江域, 王小磊, 毛逸清, 赵东升,, 来源:军事医学 年份:2015
新一代高通量测序技术的发展,推动了多个相关研究领域的发展。国际上许多研究机构正在研究利用高通量测序数据进行微生物检测的算法,目前已有一些基于高通量测序数据的微生物...
[期刊论文] 作者:毛逸清,李江域,王小磊,赵东升,, 来源:生物信息学 年份:2011
为了建立基于EBI数据库的本地SRS服务系统,进而为生物医学研究人员提供方便、快速搜索EBI常用生物数据库的web服务,同时提供一套技术机制为其他生物医学研究机构建设自己的SR...
[期刊论文] 作者:毛逸清,李江域,王小磊,赵东升,, 来源:军事医学科学院院刊 年份:2010
目的建立一个FTP服务器为院内生物医学研究人员提供快速下载NCBI常用生物数据库的FTP服务。方法采用Linux系统和perl、shell程序设计,构建FTP服务系统。结果与结论系统实现了...
[会议论文] 作者:李江域,毛逸清,王小磊,赵东升, 来源:中国生物工程学会2014年学术年会暨全国生物技术大会 年份:2014
  新一代高通量测序技术的发展,推动了很多相关研究领域的发展。国际上很多研究机构正在研究利用高通量测序数据进行微生物检测的算法,目前已有一些基于高通量测序数据的微生......
[期刊论文] 作者:刘阳, 王小磊, 李江域, 毛逸清, 赵东升,, 来源:军事医学 年份:2004
随着新一代测序技术的发展,传统的序列比对工具已无法满足测序产生的海量生物学数据分析处理的需求,研究如何利用最新的计算技术加速序列比对过程具有十分重要的意义。本文回...
[期刊论文] 作者:刘阳,王小磊,毛逸清,李江域,赵东升, 来源:军事医学 年份:2013
目的 利用图形处理器(graphic processing unit,GPU)计算技术对广泛使用的生物信息学序列比对工具BLASTN加速,服务于新一代测序技术条件下海量生物序列数据分析任务.方法 采...
[期刊论文] 作者:王小磊,李江域,毛逸清,刘阳,王玉峰,赵东升, 来源:军事医学 年份:2013
目的 构建本地化的高性能一站式数据分析平台,为生物医学研究的相关科研人员提供便捷高效的计算分析服务.方法 将Galaxy软件部署在计算集群上,集成工具软件和数据集;利用分布...
[期刊论文] 作者:李江域,王小磊,刘阳,毛逸清,赵东升,王玉民, 来源:北京生物医学工程 年份:2013
目的设计一种基于高通量测序数据的功能强大、处理速度快且不依赖于运行环境的本地化的微生物检测算法。方法对微生物基因组进行分组,每次使用一组微生物基因组提取映射到其上......
[期刊论文] 作者:赵东升,王小磊,毛逸清,李稚锋,张成岗,骆志刚, 来源:军事医学科学院院刊 年份:2004
Microsoft SFU是一个Windows环境下的高性能UNIX子系统和互操作工具,它允许Windows和UNIX计算机共享数据、安全策略和应用程序.本文通过实例,介绍如何利用SFU将Linux下的Blat...
[期刊论文] 作者:毛逸清,赵东升,李稚锋,杭兴宜,骆志刚,张成岗,, 来源:军事医学科学院院刊 年份:2006
EST是携带有表达基因部分遗传信息的cDNA片段,EST聚类是将来自同一个基因的具有重叠部分的EST整合到单一的类中,是进行后续基因表达数据分析的必要步骤。传统的串行聚类方法...
[期刊论文] 作者:肖宇,郑翔文,宋伟,佟凡,毛逸清,刘圣,赵东升, 来源:军事医学 年份:2020
目的 构建一个开放、全面、语义表达良好的新冠肺炎领域本体,用于支持新冠肺炎相关知识的共享和有效利用。方法 在生物医学顶层本体基本形式化本体(BFO)框架下,使用斯坦福大学七步法,利用Protégé和Ontofox工具,通过抽取国内外现有本体、知识库和诊疗指南中的新冠肺......
[期刊论文] 作者:王正志, 李稚锋, 杭兴宜, 毛逸清, 骆志刚, 赵东升,, 来源:国防科技大学学报 年份:2006
规模化基因表达实验所产生的大量与生物组织特定时空状态相关的cDNA和表达序列标签(EST)等信息可用于新基因的发现、基因表达模式分析和基因组的注释,从而可为转录组研究提供实......
[期刊论文] 作者:王正志, 李稚锋, 杭兴宜, 毛逸清, 骆志刚, 赵东升, 张成, 来源:国防科技大学学报 年份:2006
[会议论文] 作者:LIU Yang,MAO Yi-Qing,WANG Xiao-Lei,LI Jiang-Yu,ZHAO Dong-Sheng,刘阳,毛逸清,李江域,王小磊,赵东升, 来源:2012全国高性能计算学术年会 年份:2012
  生物序列比对是生物信息学研究中最基本的研究方法。随着生物序列数据的快速增长,大批量序列比对变得极为耗时。针对这个问题,许多已有的高性能计算技术开始用于加速序列...
[会议论文] 作者:LIU Yang,刘阳,MAO Yi-Qing,毛逸清,WANG Xiao-Lei,李江域,LI Jiang-Yu,王小磊,ZHAO Dong-Sheng,赵东升, 来源:2012全国高性能计算学术年会 年份:2012
生物序列比对是生物信息学研究中最基本的研究方法。随着生物序列数据的快速增长,大批量序列比对变得极为耗时。针对这个问题,许多已有的高性能计算技术开始用于加速序列比对过程,GPU计算就是其中之一。已有的基于GPU的生物序列比对工具过分强调速度提升,但是缺......
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