通过将城市创新过程分解为创新资源集聚、创新成果创造两阶段,运用双重投入、产出指标体系分别对城市创新绩效进行评价,结果显示:长江经济带110个地级及以上城市创新资源集聚、创新成果创造两个阶段都具有东高西低的空间分布特征,东部城市、中西部省会及省内主要城市是科技创新、产业创新的高地;中西部地区对创新资源的利用呈现两极分化状态,部分城市受发展路径锁定影响导致创新效率低下;经济环境、社会环境对创新资源集聚效率的影响程度显著高于生态环境;人才要素、资本要素是创新成果创造效率的关键因素,而国家级开发区建设通过提供良好的集群环境发挥作用。运用超效率DEA方法分析发现,城市政府行为对创新绩效提升具有积极影响,尤其是行政管理效率和政府财政投入;发达与中等发达城市的政府行为效果较为突出,欠发达城市政府治理作用整体而言偏小且内部差异较大,这与政府在欧盟区域创新中的作用状况形成了鲜明对比。