基于转录组的白沙蒿抗旱功能基因的分析

来源 :第二届全国民族生态学大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cty810
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  白沙蒿(Artemisia sphaerocephala)为菊科蒿属强旱生植物,主要分布于荒漠区和草原区的沙地,是重要的防风固沙植物.同时,白沙蒿是飞播治沙的优选物种,也是重要的饲用植物资源.本文通过转录组测序技术,对不同干旱胁迫下白沙蒿的转录组进行分析.经过de novo组装后,共得到128460条unigenes,其中有44258条基因在nr、Swiss-Prot、Pfam、KOG、GO、COG和KEGG数据库中有注释信息,其中差异表达基因有1676条.在差异表达基因中筛选出25条抗旱相关功能基因,这些基因的启动子元件多集中在MYB结合位点MBS、防御和应激反应中的顺式作用元件TC-rich repeats以及伤病响应WRKY结合位点W-box.其中经过分析,合成渗透调节物质中P5CS(合成脯氨酸的基因)2条基因均出现上调表达,与海藻糖合成相关的2条基因中有1条上调表达,可能参与了抗旱调控.保护酶系统中,仅发现POD和APX基因出现差异表达,但两类基因均出现下调表达.保护大分子物质中,LEA蛋白的8条差异表达基因中只有1条出现上调表达,水通道蛋白的9条基因都出现下调表达,与干旱的调控有关.基于转录组的白沙蒿抗旱功能基因的分析,对未来探索白沙蒿响应千旱的分子机制具有重要意义.
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