不同时期NDV地方株F基因的克隆及序列分析与基因型研究

来源 :中国畜牧兽医学会畜牧兽医生物技术学分会暨中国免疫学会兽医免疫分会第六次学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jackyray
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利用RT-PCR技术,对1998~2002年间洛阳地区的新城疫典型发病禽群中所分离到的15个地方毒株的F基因主要功能区片段进行了克隆和序列分析,并根据其47~435位核苷酸序列构建了系统进化树,确定了其毒力强弱和基因型.结果显示:依据核苷酸和推导的氨基酸同源性的不同,15个地方毒株可分为明显的三群,群内各毒株同源性较高,群间差异较大,未发现有因分离禽品种不同而引起的明显株间差异.其中第一群9株,涉及到各时间段分离的毒株和所有分离禽品种,属典型的基因Ⅶ型强毒株,高度集中于进化树的基因Ⅶ型C亚型区;第二群4株,属传统的基因Ⅵ型强毒株,分散于进化树的基因Ⅵ型区;第三群包括2株,属古典基因Ⅱ型的弱毒株,分散于进化树的基因Ⅱ型区.综合说明近年来本地区流行的新城疫病毒以新的基因Ⅶ型为主,同时兼有传统的基因Ⅵ型和古老的基因Ⅱ型;并提示基因Ⅶ型各毒株在本地区流行时间较短,株间差异不大。
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