论文部分内容阅读
microRNA(简称miRNA)是生物体内一类内源性非编码小单链RNA,长度为18~25nt.广泛存在于植物、动物、细菌、病毒等多种生物物种中,最新的miRbase 18.0报道了21 643种成熟miRNA序列以及18 226种miRNA前体序列,涉及到168个物种,其中大多数miRNA在进化上具高度保守性.miRNA通过转录后水平调控基因的表达,几乎参与调控动植物的各个生物进程中,包括生长、发育、细胞分化、增殖、代谢、凋亡、疾病发生等,在机体基因表达调控中起到重要的作用.凡纳滨对虾(Litopenaeus Vannamei)是世界对虾养殖的三大品种之一,是一种高蛋白低脂肪的优质虾种,具有较高的经济价值和营养价值.研究表明饲料中添加复合多糖,对凡纳滨对虾抗氧化酶基因的表达具有上调作用,增强虾的免疫能力.本研究旨在饲料中添加复合多糖对对虾miRNAs表达的影响,筛选和鉴定miRNAs与免疫的相关性.为之后的进一步研究打下基础.以凡纳滨对虾为研究对象,在饲料中添加100mg/kg复合多糖,饲养62天后,运用miRNA芯片检测对虾肝胰腺、鳃和肌肉三种组织混合样中差异表达的miRNA,以及实时荧光定量PCR检测9种miRNA肝胰腺、鳃和肌肉三种组织的表达差异,包括let-7、miR-279、miR-276、miR-276a、miR-998、miR-995、miR-305、miR-71和miR-100.最后运用RNAhybrid软件预测复合多糖处理后差异表达miRNA的靶基因.结果表明miRNA芯片分析结果显示67种miRNA表达有差异显著(Fold-change>1.5),其中miR-453等18种miRNA表达下调,而miR1440等49种miRNA表达量上调.以let-7为内参,实时荧光定量分析miRNA在3种组织中的表达差异.结果显示复合多糖处理后miR-995在肝胰腺表达显著下调(P<0.01).运用RNAHybrid软件分析,结果显示miR-453、miR398a和miR1130的潜在靶基因是sod(超氧化物歧化酶基因),同时miR399和miR399f的潜在靶基因是cat(过氧化氢酶基因),miR167a、miR167h、miR398a和miR-456的潜在靶基因是prx(过氧化物还原酶基因).miR-995的潜在靶基因C型凝集素和免疫Ig血蓝蛋白等.结果提示在饲料中添加复合多糖后,miRNA可能参与调控免疫相关基因sod、cat、prx或免疫调控蛋白C型凝集素和免疫Ig血蓝蛋白,从而提高凡纳滨对虾免疫力.