论文部分内容阅读
eSHAFTS是基于分子三维相似性的药物设计图形用户界面软件包。该系统为从事药物设计的专业人员及非专业药化工作者提供了一种简易便捷的操作方式，以实现药物研发流程中的常用计算方法，如虚拟筛选、骨架跃迁、药物重定位以及多向药理学研究。
eSHAFTS:基于分子三维相似性的药物设计图形用户界面系统
【摘 要】
：
eSHAFTS是基于分子三维相似性的药物设计图形用户界面软件包。该系统为从事药物设计的专业人员及非专业药化工作者提供了一种简易便捷的操作方式，以实现药物研发流程中的常用计算方法，如虚拟筛选、骨架跃迁、药物重定位以及多向药理学研究。
【机 构】
：
华东理工大学药学院,上海,200237 华东理工大学信息科学与工程学院,上海,200237
【出 处】
：
中国化学会第30届学术年会
【发表日期】
：
2016年7期
其他文献
通过借鉴控制平衡态解决热力学非平衡的方法,我们修正了传统非平衡溶剂化能计算的原理性错误,得到比传统理论较为准确的非平衡态溶剂化能,并将其应用到胞嘧啶在水溶液中光谱移动的研究中去.通过解析解公式和数值解公式计算后得到的基态S0至S1激发态吸收光谱移动为0.22ev,相比Marcus传统理论得到的0.29ev 更加靠近可参考的理论光谱移动值.但是在计算二重、三重激发态光谱移动中与QM/MM方法及其他计
QM/MM investigationon the diastereoselectivity of uncatalyzed aldol reaction between N-methyl-2,4-th
Theorigin of diastereoselectivity and role of water in the uncatalyzed aldol reaction of N-methyl-2,4-thiazolidinedione with N-methyl-isatin have been investigatedbyMonte Carlo statistical mechanics s
Insights into Conformational Regulation of PfMATE Transporter from Pyrococcus furiosus Induced by Al
Multidrug and toxic compound extrusion(MATE)family transporters induce multiple-drug resistance(MDR)of bacterial pathogens and cancer cells,thus causing critical reductions in the therapeutic efficaci
The iron(Ⅳ)-oxointermediate has been amply established as the principal oxidant in non-heme enzymes and the key player in C-H bond activations and functionalizations.In contrast to this status,our pre
DNA逃逸ɑ-溶血素纳米孔实验发现DNA在纳米孔中残存概率的多指数衰减，意味着逃逸速率的含时涨落，即动力学无序。基于涨落瓶颈模型，将DNA穿孔过程描述为穿过一个涨落的瓶颈。假设DNA逃逸速率正比于涨落瓶颈的横截面积，由纳米孔涨落的半径决定归因于纳米孔构象在多个亚态之间的跃迁。运用一维广义朗之万方程，结合高斯分数噪声和幂律摩擦内核引入构象亚扩散描述瓶颈半径的随机演化。计算与实验结果可以直接比较的非单
本文采用分子模拟方法探讨了双层石墨烯单轴压缩/拉伸变形的动力学过程。研究表明，单层石墨烯弯曲刚度取决于加载方向，而双层石墨烯弯曲刚度依赖于双层石墨烯层间相对取向。弯曲刚度的相对大小影响压缩变形中面外弯曲的方向。从两个相互垂直的方向压缩时，弯曲方向往往相反。层间距随压缩应变增加变大表明，层间相互作用逐渐弱化。双层石墨烯拉伸变形行为同样与双层石墨烯层间相对取向有关。沿扶手椅方向拉伸时，双层石墨烯断裂应
利用光能控制诸如三氮稀等含氮化合物的异构化或者断键反应，实现对其水溶液碱性的调控，开创了光化学研究新的方向，具有广阔的应用前景[1]。我们采用多组态微扰理论并结合单分子反应速率计算，研究了三氮稀在水溶液中可能的光异构化及随后的断键反应机制(Figure 1)。
表观遗传修饰相关的甲基转移酶在基因转录调控中发挥着重要作用，与肿瘤的发生、发展和预后密切相关，已成为抗肿瘤药物研究的重要靶点。
BioTriangle:a web service for computing various descriptors of small molecules,proteins,DNAs/RNAs an
Rapid advances in network biology indicate that most cellular components exert their functions through interactions with other cellular components,such as proteins,DNA,RNA and small molecules[1-3].
第二军医大学药学院药物化学教研室,上海市杨浦区国和路325号,200433拓扑异构酶Ⅱ(Topoisomerase II,Top2)是重要的抗肿瘤靶点。