Statistical Analysis,Investigation,and Prediction of the Water Positions in the Binding Sites of Pro

来源 :中国化学会第14 届全国计算(机)化学学术会议暨分子模拟国际论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:brinsh
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  Water molecules play a crucial role in biomolecular associations by mediating a hydrogen bond network or filling spaces with van der Waals interactions.
其他文献
细胞及组织的双光子显影在生物学系统研究中扮演着重要的角色。由于生物分子和生色团的竞争,自体荧光成为了紫外-可见波长激发下组织显影中亟待解决的问题[1,2]。近期,我们合成了一系列新型吡喃双氰基(DCM)衍生物(PCM、PCV、BPCM 和BPCV)。
基于小分子荧光探针在生物研究领域的广泛应用,设计合成两种类BODIPY(B1,B2)衍生物,B1,B2 的光物理性质从实验和理论方面进行了全面的研究,发现B1 具有较高的双光子吸收截面(Φδmax=869.72GM)和高量子产率(Φ=0.84).
设计合成了具有双光子效应[1,2]和生物相容性氰基羧酸小分子有机配体C1,与有机锡氧化物反应合成新型双光子氰基羧酸锡氧配合物C1Sn3并获得单晶结构。实验结合理论系统研究了配体和配合物的单双光子性质,结果表明:C1Sn3 在近红外区有较大的有效双光子吸收截面。
设计合成了一种非发射型的环金属化铱配合物Ir1.利用荧光光谱研究了它对生物分子的选择性识别,结果表明Ir1 能够快速、专一的识别组氨酸和富含组氨酸的蛋白.利用核磁滴定和激发态的密度泛函理论,系统研究了Ir1 识别组氨酸的机理.
亲合性打分函数由于其具有计算消耗小,计算结果准确性尚可等优点而得到了广泛的应用。一个标准的评价体系可以帮助研究者客观了解打分函数的性能及其局限性,为打分函数的发展奠定一个扎实的基础。
Crizotinib 作为最有效的抗肿瘤药物之一,其在MTH1 介导的RAS 依赖型肿瘤实验中依然成效显著。虽然不同的crizotinib 手性异构体在MTH1 中的结合模式完全相同(Nature 2014,508,222-227),然而这种治疗有效性仅体现在S 型crizotinib 中(并非激酶靶点中通常使用的R 型crizotinib)。
As one of the most popular computational approaches in modern structure-based drug design,molecular docking can be used not only to identify the correct conformation of a ligand within the target bind
Endocrine disrupting(ED)have become a serious public health problem.Endocrine disrupting chemicals(EDCs)mainly work by interacting with distinct hormone receptors.
Propanidid is an intravenous anesthetic with transient action and rapid recovery features,but it is clinically unacceptable due to its side effects.
Efficient and effective prediction of the Néel temperatureTN(K)is of great important to material design of ABO3 type perovskite with the space group pbnm.