基于DVM-DAC的混合粒度并行算法研究

来源 :2012全国高性能计算学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huyuxuan0601
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  多尺度现象及相关理论方法是复杂物质系统研究中重要的科学问题。传统的量子力学或分子动力学方法都难于处理多尺度体系中存在的现象。第一原理离散变分线性标度(DVM-DAC)算法是一种有效的大尺度体系计算方法。它采用分而治之的方案,获得了O(n)的计算复杂度。但由于计算规模及材料复杂性等因素,在实际研究中依然存在相当的计算瓶颈,难以满足大尺度物性研究的需要。发展了一种基于DVM-DAC的混合粒度并行算法并付诸实现,有效地解决了原有算法的计算瓶颈问题。实验结果表明,混合粒度并行算法获得良好的计算效率,处理1158个金属原子体系获得11倍以上加速比,为大尺度体系复杂金属研究提供重要工具。
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