【摘 要】
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目的:验证新基因NYGGF4在肥胖患儿脂肪组织中的表达,初步探讨NYGGF4的生物信息学特征。方法:采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术验证肥胖与正常儿童脂肪组织中NYGGF4基因的表达差异,应用DNAStar、Blast、ProtParam、SOPMA、TargetP、TMHMM、ProtScale、SOSUI、Interpro Scan和SMART等软件或数据库分析NYGGF4的核苷酸
【机 构】
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南京医科大学附属南京妇幼保健院儿科 210004 南京医科大学儿科医学研究所
【出 处】
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中华医学会第五次全国儿科中青年学术交流大会
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目的:验证新基因NYGGF4在肥胖患儿脂肪组织中的表达,初步探讨NYGGF4的生物信息学特征。
方法:采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术验证肥胖与正常儿童脂肪组织中NYGGF4基因的表达差异,应用DNAStar、Blast、ProtParam、SOPMA、TargetP、TMHMM、ProtScale、SOSUI、Interpro Scan和SMART等软件或数据库分析NYGGF4的核苷酸基本特征、蛋白质理化性质、二级结构、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、可溶性、结构域及亚细胞定位等。
结果:NYGGF4基因是一个未知的新基因,差异高表达于肥胖患儿脂肪组织中,该基因cDNA全长1527bp,开放阅读框长753bp,编码250个氨基酸,预测相对分子质量28271,定位在胞浆,蛋白序列分析显示无跨膜螺旋结构,为一非分泌、可溶的亲水性蛋白,蛋白结构域分析提示NYGGF4的N端有一较短的亲脂性靶向序列、C端有-PTB(phosphotyrosine-bindingdomain)结构域。
结论:NYGGF4基因是一差异高表达于肥胖患儿脂肪组织中的新基因,可能是胞浆内一个信号转导分子,可能在肥胖的发生发展过程中发挥重要功能,有进一步研究的价值。
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